El Jardín de Flora Autóctona (JFA) está ubicado en la Universidad de Jaén. Cuenta con 138 especies y 12 subespecies de plantas autóctonas, las más representativas de los cuatro territorios fitogeográficos de la provincia de Jaén: Guadiana Menor, Guadalquivir, Sierra Morena y Sierras Béticas.
En el JFA hay definidos 10 espacios, y para su distribución se ha seguido un criterio ecológico-florístico basado principalmente en las características geológicas, bioclimáticas y fitogeográficas: Yesos, Guadiana Menor, Guadalquivir, Sierra Morena (baja y media montaña), Sierras Béticas (baja, media y alta montaña), rocalla de flora endémica y rocalla de flora aromática. A lo largo de todo el recorrido, hay paneles con información básica de la vegetación y flora de cada uno de estos territorios.
Cada especie del JFA tiene un cartel identificativo con la siguiente información: familia botánica, género y especie o subespecie, autor/es, nombre vernáculo o vulgar y distribución mundial. En caso de tratarse de especies amenazadas se indica con un color diferente su categoría de la UICN (Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza) y en caso de estar protegidas por la legislación vigente en Andalucía, se indica con otro símbolo y color el grado de protección (En peligro, Vulnerable o Protección Especial).
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